Na anatomia comparada, além do conhecimento da estrutura corporal dos diferentes animais estudados, é fundamental relacionar a forma do corpo do organismo com seu habitat e, a partir disso, tentar compreender o seu modo de vida. A disciplina também se preocupa com a elucidação das relações evolutivas (filogenéticas) existentes entre os diferentes animais, retiradas das homologias estabelecidas entre as mais variadas estruturas que fazem parte do corpo dos animais.
